Krzysztof Kowalewski nie żyje. Pozostawił pogrążoną w żalu żonę, która wspierała go długie lata. Cierpią też jego dzieci

Kowalewski po raz pierwszy ożenił się latach 60. z kubańską tancerką, Vivian Rodriguez. Ich małżeństwo nie przetrwało jednak próby czasu. Rozwiedli się po trzech latach. Owocem ich miłości jest syn Wiktor, który od 1981 roku na stałe przebywa za granicą. Po rozstaniu z pierwszą żoną Kowalewski przez wiele lat był związany z aktorką Ewą Wiśniewską. Ta relacja także nie była trwała.

Swoją drugą żonę, aktorkę, Agnieszkę Suchorę, Krzysztof Kowalewski poznał podczas prób do spektaklu Wieczór Trzech Króli w warszawskim Teatrze Współczesnym. Chociaż parę dzieliło aż 31 lat (kobieta była od niego młodsza), połączyło silne uczucie. W wywiadzie dla Twojego stylu tak komentowała tę relację:

Aktorzy w 2002 roku wzięli ślub. Doczekali się córki Gabrieli. O tym, że Kowalewski spełniał się w małżeństwie, raczej nie można mieć wątpliwości. W jednym z wywiadów podkreślał, że dzięki Agnieszce dostał drugie życie:

Suchora jest aktorką. Od lat występuje na deskach Teatru Współczesnego. Popularność zyskała jednak dzięki udziałowi w produkcjach takich jak m.in. Daleko od noszy, Na Wspólnej oraz Pierwsza miłość. 

Kowalewski osierocił dwoje dzieci. Miał syna z pierwszego małżeństwa, Wiktora. Przez lata nie utrzymywał z dzieckiem kontaktu. W książce Skarpetka w ręku tak pisał o tacierzyństwie:

Po latach ich kontakt się poprawił. Aktualnie Wiktor mieszka w Los Angeles. Pracuje w branży sportowej. Jest też trenerem żeńskiej drużyny piłkarskiej. Syn Kowalskiego także jest ojcem. Ma córkę Sachę, która próbuje swoich sił w aktorstwie. Na ten temat zdobywa wiedzę z Ruskin School of Acting. Zagrała w filmie Proceder Michała Węgrzyna.

Kowalewski po raz drugi został ojcem ponad 18 lat temu. Z Agnieszką Suchorą powitali na świecie Gabrielę. Tym razem aktor bardzo angażował się w wychowywanie córki. Podkreślił, że wraz z pojawieniem się dziewczynki na świecie, odkrył ojcostwo na nowo. Kąpał, przewijał, a z czasem odrabiał z nią lekcje i wtajemniczał w swój zawodowy świat. Podobno mieli znakomity kontakt. Dziewczyna co jakiś czas towarzyszyła ojcu podczas branżowych wydarzeń.