Podczas światełka do nieba na scenę wdarł się nożownik, który podbiegł do Adamowicza i śmiertelnie ugodził go w serce. Mężczyzna zmarł kilka godzin po ataku. Z Adamowiczem nie zdążyła pożegnać się żona, która w tym czasie przebywała w Stanach Zjednoczonych.
Paweł Adamowicz został pochowany w Bazylice Mariackiej. 2 listopada, w dniu 54. urodzin byłego prezydenta Gdańska, została odprawiona msza święta w jego intencji. W nabożeństwie wzięła udział najbliższa rodzina zmarłego: żona Magdalena Adamowicz, córka Antonina, ojciec Ryszard Adamowicz. Nie zabrakło także Aleksandry Dulkiewicz, która po śmierci Adamowicza została wybrana na prezydent Gdańska.